El conocido seudónimo "Fibonacci" no fue utilizado por el mismo Leonardo de Pisa durante su vida. La primera mención de "Leonardo Fibonacci" (Lionardo Fibonacci) se documenta en los documentos de Perizolo (Perizolo da Pisa), notario del Sacro Imperio Romano, datados en el año 1506.

El origen del nombre "Fibonacci" está relacionado con la inscripción "filius Bonacci" en la portada de su obra "Liber Abaci". Esta frase se puede interpretar de dos maneras: como "hijo de Bonacchi" o, si se considera Bonacchi como un apellido, "hijo de Bonacci".

También existe una versión que sostiene que la propia palabra "Bonacci" era un apodo con el significado de "afortunado". Curiosamente, el propio matemático solía firmar simplemente como "Bonacci".

Además, se sabe que a veces usaba el nombre Leonardo Bigollo. En el dialecto toscano, la palabra "bigollo" tenía un doble significado: "vagamundo" y "holgazán", lo que añade un detalle intrigante más a la imagen de este destacado científico.