يمكن للحواسيب الكمومية استخدام خوارزمية شور (Shor’s algorithm) التي أنشأها عالم الرياضيات بيتر شور في عام 1994، والتي يمكنها كسر أمان الخوارزميات في التشفير غير المتماثل، وحل مشكلة اللوغاريتمات المنفصلة على المنحنى الإهليلجي بسرعة، واستنتاج المفتاح الخاص من العنوان العام، وتزوير توقيعات التداول ونقل الأصول.

حذر الباحث الأمني ديفيد كارفالو من أن تقدم الأجهزة الكمومية قد يكون "أسرع مما نتخيل". وإذا ثبت صحة هذا الافتراض، فإن دفاعات البيتكوين الحالية ستصبح مثل خزنة قديمة، في مواجهة لصوص جدد يحملون مفاتيح عامة، مما يجعلها غير فعالة.

لمواجهة التهديدات الكمومية، يتجه التركيز البحثي نحو التشفير المقاوم للكموم (PQC). وقد اعتمد المعهد الوطني للمقاييس والتقنية في الولايات المتحدة (NIST) خوارزميات مثل CRYSTALS-Dilithium كمعايير للجيل القادم. كما تقوم الصناعة بتقييم حلول التوقيع المختلطة، بحيث تتواجد التوقيعات التقليدية وPQC معًا، لتقليل مخاطر الانتقال المفاجئ. لذلك، أصبحت مرونة التشفير ذات أهمية، من خلال التصميم المعياري، مما يسمح للعقد في المستقبل بسرعة استبدال الخوارزميات حسب الحاجة.